德国问题研究所是对德交流的一个“窗口”与“平台”。研究所数次主办中国欧洲学会德国研究分会年会，每年多次举办有关德国及欧盟问题和跨文化研究的专题研讨会、专家报告会等学术活动，是上海地区德国问题学术交流的主要组织者和举办者。- 研究所与德国达姆施塔特工业大学社会学与历史学系（尤其是政治学研究所）保持有定期的教师与学生交流机制；与德国曼海姆大学、卡塞尔大学、波恩大学、汉诺威大学、柏林洪堡大学等高校有着人员与学术往来。此外，研究所与德国德意志学术交流中心（DAAD）、德国弗里德里希·艾伯特基金会、汉斯·赛德尔基金会、康拉德·阿登纳基金会也有合作。- 在积极开展学术交流的同时，研究所与德国巴伐利亚中德经济文化协会（http://www.chinaforumbayern.de/cn/）签订了合作协议，旨在为中德双方在经济、科学文化等领域更广泛的合作搭桥、提供咨询信息。